Виртуальная клетка
Научный руководитель направления «Вычислительная биология», Научный центр генетики и наук о жизни Университета «Сириус». Заведующий лабораторией биоинформатики ФИЦ Информационных и вычислительных технологий, технический директор ООО «Биософт.Ру»
Построение модульной математической модели для нескольких клеточных линий человека. Построенная модель виртуальной клетки будет с хорошей точностью воспроизводить существующие экспериментальные омиксные данные для нескольких типов клеток (клеточных линий) человека.
Это позволит как понять механизмы функционирования клетки, так и поможет заменить различные лабораторные эксперименты на эксперименты in silico.
В данном проекте предлагается новый подход, который можно представить в виде пирамиды (по убыванию объема данных): исходные омиксные данные --> их анализ и интеграция данных --> мета-анализ --> математическая модель (виртуальная клетка). Разработанная модель виртуальной клетки, верифицированная на таком разнообразии омиксных данных, послужит основой для проведения экспериментов in silico, направленных на создание современной рациональной стратегии по фундаментальному пониманию и улучшению целевых свойств исследуемых культур клеток и даже целых организмов.